• تبدیل کردن هر کدام از گروه ضرایب تضعیف مشابه به عدد صحیح .

• ذخیره آن­ها به عنوان فانتوم­های جدید در فرمت “uint16”.

• خواندن فانتوم­ها در برنامه xmedcon تحت لینوکس.

• ذخیره آن­ها در فرمت “interfile”.

• پاک کردن محتویات سر­های بدست­آمده و جایگزین­کردن آنها با اطلاعات نمونه­های سَرNCAT در گیت.

سپس چندین فایل در برنامه گیت باید بر طبق فانتوم­ها اصلاح می­گردید. این فایل­ها عبارتند از activity-rang.dat، attenuation-rang.dat، voxelized phantom.dat، source- phantom.dat و benchSPECT.mac.
برنامۀ کُد Gate ، کد با هدف خاصِ کد هدف عمومیGeant4 است. Geant4 در بسیاری از زمینه­ ها به­عنوان شبیه­ساز استفاده­می­ شود. برنامه کد Gate در زمینۀ شبیه­سازی دستگاه­های تصویربرداری SPECT، PET و غیره کاربرد دارد. این برنامه دارای انعطاف­پذیری بالایی جهت شبیه­سازی دستگاه­ها با پارامترهای دلخواه ما می­باشد. برنامۀ اصلی به چند قسمت تقسیم می­ شود که در هر قسمت با عدد­دهی و تعریف دقیق می­توان شبیه­سازی دلخواه را محقق ساخت. قسمت­ های مختلف این برنامه جهت تعریف عبارتند از :

• Head SPECT:

• Visualization: امکان تعیین مشاهده یا عدم مشاهدۀ روند شبیه­سازی به­ صورت بصری .

• Mandatory: برنامۀ کد Gate جهت خواندن و پردازش باید مواد تعریف شده در سیستم را بشناسد. در این قسمت مسیر فایل Gatematerial را در برنامه جایگذاری می نماییم.

• Geometry: در این قسمت اطلاعات محیط تعریف­شده از قبیل سیستم، سر اسکنر، روکش سر دوربین، کلیماتور (طبق شکل کلیماتور اطلاعات دقیق سوراخ­ها و دیواره­ های کلیماتور و غیره خواسته می­ شود)، کریستال، back campartment، میزی که فانتوم در روی آن قرار می­گیرد، فانتوم و چشمه باید به­ صورت کاملاً دقیق و مفصل به برنامه داده­­شود.

• Physics: که در این قسمت تمام واکنش­ها و اندرکنش­هایی که احتمال وقوع آنها در داخل سیستم وجود دارد درج­شده و یا امکان اضافه­کردن آنها وجود دارد. از جمله می­توان به پراکندگی کامپتون، پراکندگی رایلی، افر فوتوالکتریک، پراکندگی چند الکترونی، یونیزاسیون الکترونی و غیره اشاره­نمود.

• Cuts: در اینجا برهم­کنش­های مورد نظر در فاصله دلخواه قطع می­گردد.

• Initialization: در این قسمت کلیۀ اطلاعات پروجکشنی و زمان هر پروجکشن باید به برنامه داده شود.

• Digitizer: در این قسمت دربارۀ کلیه پارامترهای خصوصیات ماده رادیواکتیو، پنجره­های انرژی، انرژی آستانه و غیره پارامترهایی تعریف­شده­است که قابلیت عدد­دهی دارند.

• Output: در این قسمت کلیه خروجی­هایی که برنامه Gate حاصل می­ کند را ذکر و انتخاب فایل­های خروجی را به اختیار شما می­ گذارد.

• Random: در اینجا دربارۀ موضوعات آماری و تصادفی ممکن در سیستم بحث شده­است.

• Projection: در اینجا درباره نحوۀ پروجکشن و زاویه­ های آن عدددهی شده­است.

همان­طور که ملاحظه می­ شود وجود حجم بالای متغیرهای قابل تنظیم و زبان نزدیک به زبان انسان برای دستوردهی کامپیوتری و استفاده نسبتاً آسان، کد Gate را به شبیه­سازی بسیار قوی بدل کرده­است. شبیه­سازی­ها آنقدر به نتایج کلینیکی نزدیک هستند که در تحقیقات می­توان از استفاده از سیستم­های کلینیکی چشم­پوشی کرد.

ما در شبیه­سازی­های خود از خروجی­های *.sin و *.hrd استفاده می­نماییم. این دو خروجی، به زبان دستگاه­های تصویربرداری است و به­منظور بازسازی تصاویر نیازی به تغییر این فایل­ها وجود ندارد.
۳-۶ تصویربرداری با مدل SIMIND:
کار با این مدل بسیار آسان و نسبت به کد Gate سریع­تر است. این برنامه تحت ویندوز قابل اجرا است و در همان محیط عدد دهی و اجرا می­ شود.